Zur Gewährleistung eines Höchstmaßes an Flexibilität stehen drei Möglichkeiten des Zugangs zu den Scientific-Use-Files des NEPS zur Auswahl. Diese unterscheiden sich hinsichtlich des Grads an Anonymisierung bzw. der Verfügbarkeit sensibler Informationen und der Datensicherheitsvorkehrungen. Voraussetzung für den Datenzugang ist mindestens der Abschluss eines Datennutzungsvertrags mit dem Leibniz-Institut für Bildungsverläufe e.V.